由于多年战乱动荡，解放初期，上海宗教界的自养收入普遍大幅下降，教职人员生活受到影响，有些教堂破败不堪，寺院修缮资金匮乏。当时兼任华东局统战部部长的陈毅，布置有关同志多次与宗教界代表人士座谈，听取意见和要求，全面掌握情况。1952年春，为关心宗教政策的贯彻和宗教文物、场地的保护，统战部到各教堂寺院作深入调查研究，决定修复一些著名的教堂寺院，他们制定维修方案，上报市委、市政府，请求拨款资助修缮费用。为了解情况，陈毅专程到玉佛寺和小桃园清真寺视察。

玉佛寺时任方丈苇舫法师一贯要求进步。上海解放后，他积极响应党和政府的号召，开展生产自救。陈毅市长在赵朴初的引荐下，专门来到玉佛寺吃素餐。在玉佛寺，陈毅宣传了党的宗教政策，明确要求玉佛寺的和尚们都要安下心来，和尚要像个和尚的样子，把寺庙管好。他对苇舫法师说：“你们放心，人民政府来了之后，有明确的宗教政策，会保护你们的!你们一定会与人民政府及上海市的其他老百姓一样，日子会一天一天好起来的。”他又对小和尚说：“听说你们这些小和尚，不安心，跑的跑掉了，还俗的还俗了。你们要安心，好好学佛，好好把你们的寺庙管好。国家好了，你们这里也是会好的。”当陈毅市长看到玉佛寺住了很多不相干的军地单位后，仅仅隔了两天，就派当时华东局的领导谭震林到寺作具体了解。不久即以华东军政委员会的名义，下令让所有军地单位搬出玉佛寺，把房子交还玉佛寺重新修缮。

1952年，政府拨款修缮玉佛寺和静安寺，给了玉佛寺旧人民币5亿(相当于新人民币5万元)、静安寺1.75亿(即新币1.75万元)的维修费，由寺庙自己购买材料组织施工。此后，由于玉佛寺房客遁走没了租金，搞基建又影响了素餐经营，生活困难。政府又决定给寺中每个僧人补贴15元(新币)的生活费，全寺一共3 000元。在政府的资助下，玉佛寺香火又重新鼎盛起来。

小桃园清真寺是1925年由清真寺董事会金子云董事捐建，坐落于上海复兴东路近河南路口的小桃园街，因此被称为小桃园清真寺。陈毅来到小桃园寺后，专门向教长马宜亭阿訇询问穆斯林群众的宗教活动情况，询问教职人员的家庭生活，询问清真寺的经济来源。随着时间延续，交谈越来越投入，感情越来越融洽。马宜亭如实介绍，陈毅点头细听，不甚清楚的，刨根究底插话询问。谈到建筑年久失修渗漏严重，影响群众礼拜时，陈毅察看询问得特别详细，还提出修缮的一些具体设想。

在礼拜大殿门口，陈毅双目浏览庄重高敞的大殿，听取马宜亭讲解穆斯林礼拜的要领和仪式。他尊重伊斯兰教教规习俗，没有跨进大殿一步。登上三楼平台，陈毅仔细观看别具特色的望月亭。他右手伸出食指，向上点着说：“天上的事，你们管;人间的事，我管。大家分工把它管好。”陈毅对上海这个特大城市的清真寺依然保存得如此完整，极为赞赏;对清真寺的教务活动和管理，表示非常满意。他一再嘱咐马宜亭教长，要相信党和政府是充分保护和尊重宗教信仰自由的，让群众过好宗教生活，有困难找政府，一定予以支持。他要求宗教界团结好信教群众，与上海人民一起把上海建设好。

此后，市委统战部在调查基础上认为，伊斯兰教的小桃园清真寺虽然门前道路拥挤狭窄，但其西亚式建筑独特，历史文化底蕴深厚，具有一定代表性，应列入首批修缮范围，决定拨支修理金旧人民币11亿元(即新币11万元)资助。

从此，上海的宗教场所陆续得到了修缮和保护，宗教活动有序开展。